Fast Statistical Alignment for Linux indir

"FSA bir olasılık çoklu dizi hizalama algoritmasıdır."
indir.biz Editörü: FSA bir "mesafe kullanan bir olasılık çoklu dizi hizalama algoritmasıdır" tabanlı homolog protein, RNA veya DNA dizileri hizalayarak yaklaşımı. Çok mesafe-Komşu gibi filogenetik yeniden yöntemleri bir Phylogeny sadece pairwise sapma tahminleri kullanılarak inşa Katılma tabanlı FSA çoklu uyum homoloji sadece pairwise tahminlerini kullanarak kurar. Bu mümkün sıra pairwise karşılaştırmalar bir çok uyum oluşturmak için tavlama tekniği ile yapılır.

---

FSA yüksek hassasiyeti daha önce protein veya büyük ölçekli sorunlar RNA'lar küçük ölçekli analizler sadece bu hizalayarak olarak kullanılabilir getiriyor diziler veya megabase binlerce-uzun dizileri. FSA iyi diziler oluşturmak için birkaç yeni yöntem sunar:

---

FSA giriş dizilerinin her kümesi için anında boşluğu ve ikame parametreleri tahmin etmek için makine-öğrenme teknikleri kullanır. Bu "sorgulama ile öğrenme" yöntemi FSA uyum çok sağlam yapar: Bu homolog çok farklı evrimsel kısıtlamalarına tabidir dizilerin setleri üstün diziler üretebilir.

---

FSA, hatta yüz binlerce uyumlu hale getirme yeteneğine sahiptir dizileri çok uyum hesaplamalı maliyeti düşürmek için bir randomize çıkarım algoritması ile. Bu rastgele çıkarsama üzerinde on kat daha hızlı doğruluk az kaybı ile doğrudan bir yaklaşım daha olabilir.

---

FSA hızla çok uzun hizalayabilirsiniz "çapa çözülmesi ve geçişli demirleme onları projelendirme için" tekniği tavlama çapa kullanarak dizileri. Çapa yukarıda açıklanan yöntemleri kullanarak Arasında Daha sonra dikiş birlikte uyum.

---

Her bir karakteri göre renkli GUI, MAD (Çoklu Hizalama Display), orta diziler FSA tarafından üretilen görüntüleyebilirsiniz dahil olasılık bunun doğru Linux 1.14.0 şimdi Hızlı İstatistik Hizalama download özgür olabilir uyumludur.